Le conseil d'administration est responsable de la direction et de la gestion du CQMF. Il agit comme représentant officiel des médecins de famille et de leurs patients, auprès des différents paliers de gouvernements, des médias, du public, des médecins et autres fournisseurs de services de santé.
Il est du ressort exclusif du conseil d'administration en tant qu'autorité suprême du Collège québécois d'avoir les responsabilités suivantes:
- Déléguer au besoin, dans un but précis, ses pouvoirs et/ou obligations à un comité, un membre ou à la direction générale.
- Créer ou abolir tout comité permanent, en établir et en amender les mandats, en varier la composition et lui déléguer les pouvoirs et obligations qu'il jugera nécessaire.
- Réviser annuellement la performance et la pertinence des comités et des groupes de travail.
- Établir les politiques et la réglementation nécessaires au bon fonctionnement des opérations et activités de la corporation.
- Gérer, surveiller et évaluer ses opérations et activités afin d'en assurer la conformité relativement aux présents règlements, à la mission et aux objectifs de la corporation et du CMFC.
- Assurer la saine gestion financière de la corporation.
- Recueillir des fonds ou cotiser les membres pour les projets qu'il jugera appropriés.
- Investir, le cas échéant, l'argent de la corporation en se limitant à des véhicules de placements à risque minimal.
- Approuver la date de la tenue de l'AGA et le lieu où celle-ci doit avoir lieu;
- Emprunter de l'argent dans des conditions qu'il jugera acceptables.
- Faire rapport aux membres lors de l'AGA.
- Identifier les rôles et les responsabilités du CD et des différents comités pour la mise en application de toutes les politiques, activités ou programmes approuvés.
- Veiller à la pérennité de la corporation.
- Combler toute vacance à un poste d'administrateur, de dirigeant ou de membre de comité devenu vacant dans le meilleur intérêt de la corporation.
- Consulter les membres par référendum selon les règles et modalités qu'il détermine.
Le conseil d'administration est responsable vis-à-vis des membres et fera un rapport aux membres lors de l'assemblée générale annuelle. Le conseil d'administration révisera annuellement la performance et la pertinence des comités.
Le conseil d'administration pour l'année 2012 est composé des membres suivants:

Dr Antoine Groulx
Président du comité de direction
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Dre Dominique Deschênes
Présidente désignée
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Dre Annick Turcotte
Secrétaire-trésorière
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Dre Caroline Laberge
Vice-présidente aux communications |

Dre Leonora Lalla
Vice-présidente au développement professionnel continu |

Mme Nicole Cloutier
Directrice générale |

Dre Eveline Hudon
Représentante des membres |

Dre Line Langlois
Représentante des membres |

Dre Justine Galarneau-Girard
Représentante des résidents |

Dre Jessica Lee
Représentante des résidents |

Mme Marie-Claude Moore
Représentante des étudiants,
GIMF Université de Montréal |

Mme Marie-Maude Morin
Représentante des étudiants, GIMF Université de Sherbrooke |

Dre Johanne Théorêt
Représentante régionale
(Est-du-Québec) |

Dr Réjean Duplain
Représentant régional
(
Sud-du-Québec) |

Vacant
Représentant régional
(
Nord-Ouest-du-Québec) |

Dre Maxine Dumas-Pilon
Représentante régionale
(Métropole) |

Dre Marie Giroux
Représentante des départements de médecine familiale |

Dre Marie-Pierre Dumas
Représentante de la section enseignement |

Dr Hanna Nicolas
Représentant de la section intérêts particuliers ou pratiques ciblées |

Dr Philippe Karazivan
Représentant de la section recherche |

Dr Jean Zigby
Représentant du comité santé et environnement
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Le personnel administratif est composé de:

Mme Marie-Josée Campbell
Coordonnatrice au développement professionnel continu |

Mme Pascale Rolland
Agente aux communications
et à la direction |